重慶中國藥科大學創新研究院是由中國藥科大學和重慶兩江新區管理委員會共同創辦的事業單位。研究院致力于原創新藥發現研究和高端制劑研發及產業化，采取“1+X”的組織架構，即1個研究院+多個平臺、基地、中心的建設模式，下設新藥研究中心、實驗動物中心、高端制劑研究中心、藥物分析檢測中心、生物學研究中心5大技術平臺，形成以藥物研發、技術服務、產業孵化、人才培養為核心業務的高端研發機構。